50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0502 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  100 
 
 		 408 aa  838    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  49.27 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  45.37 
 
 		 405 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  45.12 
 
 		 413 aa  339  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  42.82 
 
 		 418 aa  323  5e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  40.05 
 
 		 438 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  38.61 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  39.85 
 
 		 388 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  39.45 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  39.1 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  38.41 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  37.09 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  28.11 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  30.46 
 
 		 503 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  30.58 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  30.9 
 
 		 513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  31.53 
 
 		 513 aa  126  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  30.9 
 
 		 513 aa  126  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  30.42 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  31.01 
 
 		 511 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  32.93 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  29.59 
 
 		 502 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  29.79 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  27.54 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  29.97 
 
 		 384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  29.32 
 
 		 502 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  31.5 
 
 		 390 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  31.71 
 
 		 403 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  28.77 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  29.97 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  31.68 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  30.79 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  28.86 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  28.53 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  30.06 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  28 
 
 		 503 aa  113  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  27.86 
 
 		 407 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  30.79 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  26.81 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  27.03 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  28.09 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  28.36 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  26.93 
 
 		 500 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  28.07 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  27.22 
 
 		 404 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  27.62 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  29.94 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  25.71 
 
 		 438 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  27.01 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  25.89 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>