61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1805 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  91.75 
 
 		 388 aa  751    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  798    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  93.56 
 
 		 388 aa  758    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  78.76 
 
 		 388 aa  654    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  66.08 
 
 		 410 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  40.95 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  40.9 
 
 		 414 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  40 
 
 		 427 aa  295  7e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  39.85 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  41.23 
 
 		 438 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  39.6 
 
 		 418 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  39.1 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  33.12 
 
 		 511 aa  120  6e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  30.38 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  31.15 
 
 		 502 aa  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  33.11 
 
 		 513 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  31.25 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  32.54 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  31.15 
 
 		 502 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  32.15 
 
 		 513 aa  110  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  32.99 
 
 		 513 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  31.92 
 
 		 502 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  28.26 
 
 		 500 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  29.35 
 
 		 500 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  29.28 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  27.15 
 
 		 412 aa  89.7  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  28.48 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  27.18 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  26 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  27 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  30.26 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  26.82 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  27.09 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  24.08 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  25.33 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  25.67 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  28.61 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  25.99 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  25.63 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  24.91 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  23.68 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  24.92 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  24.41 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  25.86 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  23.53 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  24.1 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  26.2 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  26.54 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  22.8 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  27.11 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1546  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.03 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0841  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.87 
 
 		 203 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0586369  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2148  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.38 
 
 		 508 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40 
 
 		 858 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0382  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 162 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.248119  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 367 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1695  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 		 113 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1271  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.48 
 
 		 201 aa  43.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10134  normal  0.880841 
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  36.36 
 
 		 640 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.97 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>