More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1272 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  63.33 
 
 
502 aa  664    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  65.14 
 
 
503 aa  688    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  1026    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  69.94 
 
 
502 aa  738    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  73.9 
 
 
502 aa  781    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  60.76 
 
 
503 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  57.52 
 
 
500 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  56.4 
 
 
500 aa  590  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  50.78 
 
 
513 aa  518  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  49.42 
 
 
513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  49.03 
 
 
513 aa  510  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  50 
 
 
513 aa  508  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  48.46 
 
 
511 aa  501  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  47.37 
 
 
423 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  49.74 
 
 
399 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  49.61 
 
 
403 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  49.34 
 
 
412 aa  364  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  49 
 
 
406 aa  363  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  48.88 
 
 
408 aa  360  3e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  49.14 
 
 
408 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  47.69 
 
 
407 aa  356  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  47.38 
 
 
408 aa  353  4e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  49.47 
 
 
390 aa  353  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  46.74 
 
 
390 aa  344  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  47.35 
 
 
390 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  45.55 
 
 
455 aa  342  7e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  50.26 
 
 
405 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  48.31 
 
 
421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  48.82 
 
 
434 aa  335  9e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  45.04 
 
 
438 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  42.21 
 
 
403 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  43.93 
 
 
389 aa  330  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  42.37 
 
 
390 aa  322  9.000000000000001e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  43.09 
 
 
384 aa  319  9e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  43.41 
 
 
389 aa  317  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  43.01 
 
 
388 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  42.26 
 
 
404 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  42.26 
 
 
404 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  34.97 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  33.94 
 
 
418 aa  146  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  33 
 
 
414 aa  133  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  31.9 
 
 
405 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  30.12 
 
 
438 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  30.16 
 
 
427 aa  123  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  28.77 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  31.92 
 
 
388 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  31.94 
 
 
388 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  31.94 
 
 
388 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  45.3 
 
 
491 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  29.28 
 
 
388 aa  103  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  27.89 
 
 
410 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  42.74 
 
 
496 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  43.7 
 
 
490 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  43.59 
 
 
490 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  37.5 
 
 
488 aa  94  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  40.34 
 
 
579 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  40.35 
 
 
487 aa  87.4  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  33.07 
 
 
492 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  36 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  33.64 
 
 
302 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  35.71 
 
 
127 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
376 aa  63.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  33.33 
 
 
145 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
625 aa  60.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 
142 aa  60.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  29.03 
 
 
124 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  29.01 
 
 
141 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  28.79 
 
 
224 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 
141 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
145 aa  60.1  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 
141 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  31.4 
 
 
300 aa  59.3  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
137 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
141 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  31.62 
 
 
137 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
141 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
141 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
141 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  23.81 
 
 
372 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  33.33 
 
 
140 aa  57.4  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.5 
 
 
208 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 
215 aa  57  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  31.62 
 
 
379 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  31.58 
 
 
149 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  31.09 
 
 
216 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  30.97 
 
 
139 aa  56.2  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  28.93 
 
 
155 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 
216 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  27.93 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  29.91 
 
 
137 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2674  signal transduction protein  25.37 
 
 
166 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  hitchhiker  0.0000000000000277355 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  26.45 
 
 
300 aa  55.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
211 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  31.82 
 
 
148 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  31.88 
 
 
232 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  27.12 
 
 
139 aa  54.7  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
137 aa  54.7  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 
152 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  23.81 
 
 
366 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>