50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0414 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  791    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  73.96 
 
 		 384 aa  589  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  71.39 
 
 		 403 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  71.39 
 
 		 404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  71.39 
 
 		 404 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  71.61 
 
 		 389 aa  567  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  71.95 
 
 		 389 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  70.18 
 
 		 438 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  49.87 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  49.21 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  51.17 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  48.12 
 
 		 412 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  44.09 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  48.55 
 
 		 403 aa  357  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  51.05 
 
 		 405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  46.43 
 
 		 407 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  45.7 
 
 		 500 aa  342  8e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  46.63 
 
 		 390 aa  339  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  42.75 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  42.37 
 
 		 500 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  45 
 
 		 503 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  45.67 
 
 		 390 aa  334  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  44.31 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  45.45 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  45.45 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  43.19 
 
 		 503 aa  323  5e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  42.37 
 
 		 502 aa  322  6e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  43.38 
 
 		 511 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  44.56 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  43.19 
 
 		 388 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  42.64 
 
 		 513 aa  318  1e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  42.11 
 
 		 502 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  41.6 
 
 		 513 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  42.4 
 
 		 502 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  41.86 
 
 		 513 aa  311  9e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  40.8 
 
 		 513 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  42.51 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  42.82 
 
 		 421 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  30.93 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  30.77 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  29.49 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  28.62 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  27.94 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  27.89 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  29.94 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  24.81 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  22.8 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  21.9 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  20.07 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  22.18 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>