142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0110 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  832    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  56.37 
 
 		 414 aa  450  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  50.86 
 
 		 405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  49.63 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  47.36 
 
 		 438 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  43.17 
 
 		 427 aa  349  4e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  45.12 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  39.85 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  40.25 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  39.24 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  38.75 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  38.48 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  32.7 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  33.44 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  33.53 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  33.02 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  33.85 
 
 		 503 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  33.23 
 
 		 513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  34.97 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  33.02 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  32.3 
 
 		 503 aa  144  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  33.23 
 
 		 502 aa  142  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  32.7 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  32.25 
 
 		 403 aa  140  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  32.03 
 
 		 513 aa  139  7e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  33.54 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  32.44 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  29.18 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  33.96 
 
 		 502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  30.84 
 
 		 502 aa  136  9e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  32.92 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  31.58 
 
 		 500 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  31.23 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  31.01 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  30.65 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  30.75 
 
 		 384 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  32.72 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  30.06 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  31.46 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  29.79 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  30.95 
 
 		 389 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  29.48 
 
 		 408 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  31.35 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  30.93 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  29.72 
 
 		 438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  28.74 
 
 		 404 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  29.79 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  28.74 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  28.93 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  26.06 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.71 
 
 		 278 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3263  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.64 
 
 		 257 aa  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0320677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3387  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 281 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27740  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  41.79 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02120  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  44.78 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2056  hydrogenase, Fe-only  41.51 
 
 		 644 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1139  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  46.3 
 
 		 288 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.079984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2266  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.32 
 
 		 279 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1630  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.58 
 
 		 206 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06130  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  45.45 
 
 		 208 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1742  iron-sulfur cluster-binding protein  33.7 
 
 		 251 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.275476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2427  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 248 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185028 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0608  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.09 
 
 		 193 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.832632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0113  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.68 
 
 		 190 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27680  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  41.79 
 
 		 205 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 505 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02586  hypothetical protein  36.51 
 
 		 257 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0048  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 65 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4941  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.61 
 
 		 251 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822381  normal  0.193162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3099  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.82 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0141541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0778  formate dehydrogenase, iron-sulfur subunit  33.87 
 
 		 277 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3920  periplasmic Fe hydrogenase, large subunit  33.87 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1613  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.48 
 
 		 531 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  33.87 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0048  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 65 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 		 623 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  40.74 
 
 		 624 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1438  glycyl-radical enzyme activating protein family  41.51 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1060  formate dehydrogenase beta subunit  33.87 
 
 		 277 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0770769 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  40.38 
 
 		 594 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0711  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.312278  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.122426  normal  0.0426558 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  37.7 
 
 		 156 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3157  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 230 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1655  NADH dehydrogenase (quinone)  39.66 
 
 		 627 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0647  NADH dehydrogenase subunit I  31.31 
 
 		 154 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.413211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  38.98 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3825  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.297375  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0058  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.95 
 
 		 243 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1868  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.81 
 
 		 206 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0599402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.1 
 
 		 182 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0498  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.55 
 
 		 212 aa  44.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0310  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.87 
 
 		 128 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  34.62 
 
 		 244 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.96 
 
 		 217 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.986536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  31.07 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0946  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 577 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0498  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.84 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0859  iron-sulfur cluster protein  32.61 
 
 		 262 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278269  normal  0.957276 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>