58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2978 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  824    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  51.35 
 
 
414 aa  430  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  50.86 
 
 
413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  44.23 
 
 
438 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  43.27 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  45.37 
 
 
408 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  45.59 
 
 
418 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  40.95 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  39.51 
 
 
410 aa  298  8e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  40.2 
 
 
388 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  39.7 
 
 
388 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  40.55 
 
 
388 aa  293  5e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  29.28 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  32.82 
 
 
503 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  31.21 
 
 
399 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  30.61 
 
 
389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  29.97 
 
 
388 aa  133  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  32.21 
 
 
503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  30.58 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  28.41 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  31.9 
 
 
502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  32.62 
 
 
502 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  30.37 
 
 
421 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  29.67 
 
 
384 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  29.61 
 
 
390 aa  125  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  30.37 
 
 
502 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  29.97 
 
 
513 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  30.61 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  29.67 
 
 
513 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  28.86 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  29.02 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  28.32 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  29.08 
 
 
513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  29.48 
 
 
423 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  28.4 
 
 
502 aa  119  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  29.57 
 
 
408 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  29.94 
 
 
513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  29.14 
 
 
500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  29.12 
 
 
511 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  28.88 
 
 
500 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  30.25 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  28.86 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  28.03 
 
 
408 aa  110  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  27.27 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  27.63 
 
 
455 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  27.4 
 
 
404 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  27.33 
 
 
438 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  27.12 
 
 
404 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  27.89 
 
 
390 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  28.08 
 
 
434 aa  92.8  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2541  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.85 
 
 
290 aa  46.6  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000365571  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.82 
 
 
444 aa  44.3  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1797  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.67 
 
 
258 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  42 
 
 
623 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0554  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.86 
 
 
127 aa  43.5  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  29.21 
 
 
306 aa  43.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  34.33 
 
 
607 aa  43.1  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  34.33 
 
 
607 aa  43.1  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>