50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2393 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  79.58 
 
 
389 aa  656    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  79.06 
 
 
389 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  789    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  77 
 
 
438 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  75.83 
 
 
403 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  75.26 
 
 
404 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  75 
 
 
404 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  73.96 
 
 
390 aa  589  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  50.52 
 
 
399 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  52.34 
 
 
406 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  48.95 
 
 
412 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  48.17 
 
 
423 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  47 
 
 
455 aa  362  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  48.21 
 
 
407 aa  356  5e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  49.21 
 
 
405 aa  352  5e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  49.21 
 
 
403 aa  352  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  47.79 
 
 
390 aa  348  8e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  46.46 
 
 
390 aa  345  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  45.24 
 
 
503 aa  342  9e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  44.68 
 
 
513 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  45.5 
 
 
434 aa  340  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  47.01 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  44.5 
 
 
500 aa  339  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  44.68 
 
 
511 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  45.45 
 
 
500 aa  334  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  43.12 
 
 
513 aa  333  4e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  43.12 
 
 
513 aa  331  1e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  44.42 
 
 
513 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  44.53 
 
 
388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  44.19 
 
 
408 aa  322  5e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  42.67 
 
 
502 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  43.43 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  43.09 
 
 
502 aa  319  7e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  43.18 
 
 
408 aa  316  4e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  43.58 
 
 
502 aa  316  5e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  44.01 
 
 
502 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  45.09 
 
 
421 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  42.03 
 
 
503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  32.17 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  30.75 
 
 
413 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  29.67 
 
 
405 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  29.97 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  27.93 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  27.16 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  26.9 
 
 
438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  23.91 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  25.08 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  24.41 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  24.75 
 
 
388 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  25.26 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>