50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0805 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  833    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  92.89 
 
 		 408 aa  770    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  91.42 
 
 		 408 aa  759    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  66.75 
 
 		 407 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  58.29 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  60.61 
 
 		 399 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  57.54 
 
 		 423 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  60.1 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  58.08 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  56.71 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  58.59 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  55.47 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  52.86 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  53.12 
 
 		 421 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  51.72 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  49.14 
 
 		 502 aa  371  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  48.56 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  48.18 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  50.13 
 
 		 455 aa  365  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  47.25 
 
 		 502 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  47.98 
 
 		 503 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  46.37 
 
 		 389 aa  352  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  49.22 
 
 		 434 aa  350  4e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  44.86 
 
 		 389 aa  345  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  46 
 
 		 502 aa  344  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  45.9 
 
 		 438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  45.98 
 
 		 502 aa  343  4e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  45.45 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  44.64 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  44.39 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  46.19 
 
 		 511 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  45.94 
 
 		 513 aa  335  7e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  44.19 
 
 		 384 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  45.94 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  43.42 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  45.69 
 
 		 513 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  45.18 
 
 		 513 aa  323  5e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  42.07 
 
 		 503 aa  322  8e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  31.22 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  29.94 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  29.57 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  28.13 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  27.95 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  28.09 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  25 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  24.56 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  25.92 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  27.11 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  25.49 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  24.22 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>