50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5211 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  77.72 
 
 
404 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  77.97 
 
 
404 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  100 
 
 
403 aa  826    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  75.51 
 
 
389 aa  633  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  74.75 
 
 
389 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  75.83 
 
 
384 aa  623  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  74.01 
 
 
438 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  71.39 
 
 
390 aa  579  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  50.39 
 
 
399 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  52.7 
 
 
406 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  49.35 
 
 
423 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  48.48 
 
 
412 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  50.52 
 
 
405 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  49.49 
 
 
407 aa  362  9e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  48.85 
 
 
403 aa  358  7e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  45.41 
 
 
455 aa  353  2e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  45.92 
 
 
513 aa  348  7e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  47.33 
 
 
390 aa  346  5e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  45.59 
 
 
511 aa  343  2e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  45.41 
 
 
513 aa  342  7e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  44.64 
 
 
513 aa  340  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  42.39 
 
 
500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  46.05 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  43.91 
 
 
503 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  45.8 
 
 
390 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  43.22 
 
 
513 aa  333  3e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  42.21 
 
 
502 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  44.39 
 
 
500 aa  329  4e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  43.04 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  42.28 
 
 
434 aa  325  1e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  42.17 
 
 
502 aa  323  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  41.62 
 
 
503 aa  322  5e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  44.9 
 
 
421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  42.64 
 
 
502 aa  318  9e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  44.22 
 
 
408 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  43.42 
 
 
408 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  40.61 
 
 
502 aa  316  5e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  43.7 
 
 
408 aa  312  5.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  30.98 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  30.06 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  28.53 
 
 
408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  27.38 
 
 
427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  27.27 
 
 
405 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  26.59 
 
 
418 aa  109  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  27.19 
 
 
438 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  24.58 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  26.69 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  23.62 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  24.92 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  25.24 
 
 
388 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>