More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1290 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  100 
 
 		 502 aa  1026    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  65.93 
 
 		 503 aa  679    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  69.92 
 
 		 502 aa  733    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  73.9 
 
 		 502 aa  781    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  60.76 
 
 		 502 aa  637    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  58.52 
 
 		 503 aa  597  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  54.4 
 
 		 500 aa  586  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  54.71 
 
 		 500 aa  586  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  48.15 
 
 		 513 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  48.05 
 
 		 511 aa  486  1e-136  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  47.57 
 
 		 513 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  47.38 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  46.58 
 
 		 513 aa  480  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  50.53 
 
 		 412 aa  369  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  48.15 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  50.26 
 
 		 399 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  50.79 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  46.63 
 
 		 403 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  49.09 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  47.63 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  46 
 
 		 408 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  49.47 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  45.26 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  45.5 
 
 		 408 aa  329  8e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  46.6 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  40.09 
 
 		 455 aa  327  4.0000000000000003e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  45.51 
 
 		 434 aa  325  9e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  42.67 
 
 		 384 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  45.36 
 
 		 390 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  43.04 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  43.97 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  40.61 
 
 		 403 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  42.11 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  43.81 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  42.23 
 
 		 389 aa  304  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  39.95 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  39.69 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  41.42 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  34.68 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  33.23 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  32.42 
 
 		 418 aa  136  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  29.94 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  32.62 
 
 		 405 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  31.21 
 
 		 438 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  29.32 
 
 		 408 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  28.81 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  31.15 
 
 		 388 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  30.42 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  30.42 
 
 		 388 aa  107  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  28.08 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  38.69 
 
 		 488 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  41.3 
 
 		 490 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  43.8 
 
 		 491 aa  97.8  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  41.67 
 
 		 496 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  39.17 
 
 		 579 aa  91.3  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  40 
 
 		 490 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  31.34 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  43.24 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.88 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 139 aa  64.7  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 		 625 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  29.84 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  33.62 
 
 		 139 aa  63.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  34.17 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  29.69 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  32 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  36.67 
 
 		 141 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  32.06 
 
 		 149 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.29 
 
 		 605 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  28.03 
 
 		 224 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.51 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  32.31 
 
 		 282 aa  57  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  32.26 
 
 		 614 aa  57  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 127 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  31.62 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  28.81 
 
 		 138 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  25 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  28.7 
 
 		 295 aa  56.6  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  32.5 
 
 		 166 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0184  putative signal transduction protein with CBS domains  33.9 
 
 		 142 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 280 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 		 232 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.39 
 
 		 210 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  30.33 
 
 		 300 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 282 aa  55.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  27.94 
 
 		 140 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  31.78 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 		 157 aa  54.7  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.58 
 
 		 504 aa  54.3  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.97 
 
 		 845 aa  54.3  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  28.5 
 
 		 480 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  31.93 
 
 		 139 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  32.8 
 
 		 216 aa  53.9  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  28.9 
 
 		 480 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>