More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1627 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
379 aa  759    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  66.14 
 
 
381 aa  504  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  62.08 
 
 
398 aa  495  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  63.42 
 
 
384 aa  489  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  61.3 
 
 
385 aa  485  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  41.27 
 
 
411 aa  264  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3809  putative signal transduction protein with CBS domains  35.4 
 
 
407 aa  219  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  25.19 
 
 
399 aa  89.7  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25.45 
 
 
380 aa  89  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  24.02 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  24.55 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  24.76 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  24.38 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  22.9 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  25.19 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  24.33 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  23.84 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  23.59 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  26.32 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1990  CBS domain containing protein  28.22 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  23.77 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1815  signal-transduction protein  30.73 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  28.86 
 
 
214 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  28.86 
 
 
214 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  28.86 
 
 
214 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  28.86 
 
 
214 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  26.55 
 
 
282 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  28.86 
 
 
214 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  28.86 
 
 
214 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  28.86 
 
 
214 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  28.86 
 
 
214 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  28.86 
 
 
214 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3709  putative signal transduction protein with CBS domains  28.28 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  28.19 
 
 
214 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  28.19 
 
 
214 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.48 
 
 
243 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  23.9 
 
 
277 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  29.21 
 
 
302 aa  60.1  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 
223 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.64 
 
 
675 aa  59.7  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  25.84 
 
 
258 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  25 
 
 
262 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  25.81 
 
 
302 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  27.1 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 
256 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  34.31 
 
 
213 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
133 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  24.22 
 
 
280 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  28.03 
 
 
511 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  23.39 
 
 
272 aa  56.2  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  21.53 
 
 
282 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  30.56 
 
 
513 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  32.98 
 
 
149 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 
184 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  27.12 
 
 
283 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  27.22 
 
 
490 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  35 
 
 
502 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  31.07 
 
 
302 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  30 
 
 
513 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
215 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  25.17 
 
 
153 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  30.37 
 
 
496 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  31.54 
 
 
211 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  29.71 
 
 
224 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  28.91 
 
 
136 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  35.11 
 
 
162 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.82 
 
 
461 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.82 
 
 
461 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  28.87 
 
 
149 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  27.17 
 
 
249 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  25 
 
 
303 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  29.93 
 
 
151 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  30.56 
 
 
203 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  31.43 
 
 
487 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  26.76 
 
 
243 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  24.9 
 
 
252 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  29.77 
 
 
209 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  23.89 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  34.65 
 
 
139 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  24.44 
 
 
139 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  24.56 
 
 
303 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  29.29 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  24.2 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  29.09 
 
 
513 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  28.15 
 
 
226 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 
211 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.45 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  25.54 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  29.9 
 
 
138 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  27.27 
 
 
202 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  32 
 
 
145 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  27.41 
 
 
224 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  23.58 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.03 
 
 
605 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  30.47 
 
 
502 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  28.33 
 
 
139 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>