More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0640 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  288  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  288  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  288  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  95.74 
 
 
172 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  91.49 
 
 
142 aa  266  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  90.07 
 
 
141 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  90.07 
 
 
141 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  90.07 
 
 
141 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  90.07 
 
 
141 aa  263  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  78.1 
 
 
142 aa  220  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  74.29 
 
 
141 aa  214  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  69.29 
 
 
140 aa  205  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 
139 aa  205  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 
139 aa  202  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  69.78 
 
 
139 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  33.58 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  33.1 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  33.58 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  32.12 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  30.08 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  32.14 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  29.93 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  29.85 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  29.85 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  29.85 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
225 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
873 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 
216 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  31.54 
 
 
500 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  32.82 
 
 
216 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.06 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  27.69 
 
 
503 aa  61.6  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
215 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  30.53 
 
 
502 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  30.83 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  22.86 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  29.03 
 
 
491 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  32.61 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  29.23 
 
 
217 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  29.23 
 
 
490 aa  58.9  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
211 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  30.22 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  30.5 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  28.36 
 
 
214 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  28.46 
 
 
488 aa  57.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  28.24 
 
 
502 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  30.53 
 
 
883 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  26.81 
 
 
376 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  29.1 
 
 
162 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  28.36 
 
 
282 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.66 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  26.92 
 
 
579 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 
640 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  29.71 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  29.55 
 
 
382 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  31.06 
 
 
490 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
373 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
211 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.2 
 
 
216 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 
202 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.74 
 
 
256 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  30.22 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  29.23 
 
 
208 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  30 
 
 
417 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  26.49 
 
 
246 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  26.72 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  25.53 
 
 
223 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  26.72 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  29.23 
 
 
208 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  30.3 
 
 
382 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  26.95 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  29.01 
 
 
867 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  25.58 
 
 
181 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  28.57 
 
 
487 aa  55.1  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
279 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 
208 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  34.59 
 
 
577 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 
232 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  28.68 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  26.72 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 
636 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  27.86 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  27.86 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  27.86 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  27.86 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  28.47 
 
 
216 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  28.36 
 
 
210 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  30 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  25.95 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.78 
 
 
230 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4239  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716364  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  26.67 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 
386 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  23.94 
 
 
890 aa  52.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>