More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01043 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  317  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  90.15 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  69.13 
 
 		 169 aa  218  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  60.27 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  40.14 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  40 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  39.57 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  37.93 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  36.42 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  37.69 
 
 		 214 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  36.24 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  35.42 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  34.46 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  34.46 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  37.69 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  33.78 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  33.78 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.8 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  35.29 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  35.29 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  35.29 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  30.08 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  32.31 
 
 		 492 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  33.61 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  34.33 
 
 		 223 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  30.99 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.95 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  34.29 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.12 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.08 
 
 		 490 aa  63.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  28 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  32.54 
 
 		 867 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.84 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  35.07 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 		 225 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  29.51 
 
 		 487 aa  61.6  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  30.94 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  31.16 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.92 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  34.43 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.65 
 
 		 488 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  33.33 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  28.17 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  25.87 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  27.7 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  30.88 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  30.88 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.93 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.56 
 
 		 489 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 432 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 640 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  29.37 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  28.99 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  29.08 
 
 		 862 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.6 
 
 		 476 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  33.61 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  28 
 
 		 493 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  28.68 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 688 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  27.05 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  26.4 
 
 		 494 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  31.21 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  27.4 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  25.17 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  25.32 
 
 		 508 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>