More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0268 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  343  8.999999999999999e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  72.73 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  68.89 
 
 		 154 aa  197  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  59.86 
 
 		 147 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  41.67 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  41.84 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  39.16 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  38.41 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  39.29 
 
 		 142 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  38.26 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  38.69 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  38.69 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  38.69 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  38.46 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 		 142 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  34.31 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  35.29 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  38.35 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  38.35 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  36.15 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  32.14 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  33.54 
 
 		 640 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  32.84 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  37.24 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  33.78 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  33.78 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  31.43 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  33.78 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  32.37 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  36.09 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  36.15 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.25 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  35.43 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.51 
 
 		 490 aa  65.1  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  35.66 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  32.54 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  34.06 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.36 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  36.89 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  32.12 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  35.09 
 
 		 487 aa  62.4  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  36.7 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  35.54 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.71 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  31.15 
 
 		 492 aa  61.2  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  28.47 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  33.88 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  32.33 
 
 		 215 aa  60.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 		 313 aa  60.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  32.81 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.8 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  34.17 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 427 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6936  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.94 
 
 		 490 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.294111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  36.07 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.32 
 
 		 605 aa  58.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  28.48 
 
 		 249 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  32.12 
 
 		 490 aa  58.2  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  27.81 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  28.68 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  29.85 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  31.4 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  25.18 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  30.83 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>