185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1798 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2228  signal-transduction protein  57.65 
 
 		 258 aa  311  9e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2669  putative transcriptional regulator, XRE family  55.95 
 
 		 258 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2904  signal-transduction protein  49.8 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  51.37 
 
 		 257 aa  258  9e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  37.15 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  35.55 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  32.41 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  25.28 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  27.34 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  36.08 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  29.22 
 
 		 160 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  23.38 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  22.15 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 		 120 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  30.91 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 		 427 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  23.11 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  34.88 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  30.47 
 
 		 133 aa  53.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  29.31 
 
 		 158 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  26.8 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.58 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  22.7 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  31.58 
 
 		 132 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  28.33 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  24.69 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 		 133 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  22.46 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  26.92 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  31.53 
 
 		 863 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.66 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  32.5 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  22.26 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  26.38 
 
 		 315 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  25 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  27.55 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  26.18 
 
 		 380 aa  50.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  28.93 
 
 		 185 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  26.11 
 
 		 411 aa  49.7  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  27.93 
 
 		 124 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 140 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  28.22 
 
 		 413 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.53 
 
 		 605 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  25.47 
 
 		 386 aa  49.3  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  31.96 
 
 		 863 aa  49.3  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  24.43 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  30.85 
 
 		 875 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  28.22 
 
 		 399 aa  48.9  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  29 
 
 		 138 aa  48.9  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  32.63 
 
 		 148 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.37 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  29.91 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.1 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  32.98 
 
 		 879 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  23.3 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  31.91 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  29.51 
 
 		 154 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  28.83 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  32.98 
 
 		 879 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  30.53 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  24.56 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  31.76 
 
 		 189 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  28.83 
 
 		 412 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0164  signal transduction protein  21.09 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000193736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 		 171 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11090  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.56 
 
 		 640 aa  47  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000431734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  37.04 
 
 		 155 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  25.77 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  23.73 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  34.04 
 
 		 364 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  26.67 
 
 		 132 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  24.17 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.5 
 
 		 155 aa  46.6  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  26.15 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  25.21 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 		 201 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  25.18 
 
 		 146 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  23.44 
 
 		 315 aa  45.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  23.21 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  26.32 
 
 		 907 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 		 279 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  29.58 
 
 		 333 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  23.91 
 
 		 845 aa  45.4  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  30.85 
 
 		 883 aa  45.4  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  28.72 
 
 		 378 aa  45.8  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  23.02 
 
 		 161 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  29.47 
 
 		 149 aa  45.4  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  27.96 
 
 		 120 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  24.37 
 
 		 215 aa  45.4  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 		 885 aa  45.4  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  26.17 
 
 		 375 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.91 
 
 		 150 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  28.32 
 
 		 603 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>