More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0410 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  100 
 
 
124 aa  248  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  64.75 
 
 
124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  36.97 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  43.56 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  38.66 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  33.9 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  36.13 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  37.96 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  39.05 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  34.55 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  40.4 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  32.48 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  37.07 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  45.19 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  35.59 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  38.94 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  32.97 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  42.11 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 
688 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  40.43 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  36.08 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  40 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  32.17 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  35.19 
 
 
142 aa  67  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  34.26 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  32.17 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  36.27 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  32.17 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  31.3 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  31.15 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  35 
 
 
142 aa  66.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  38.3 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  32.17 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  36.36 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  41.9 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  35.35 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  42.99 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  35.19 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  35.92 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  34.26 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  32.71 
 
 
618 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  31.43 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  36.44 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  31.25 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  28.81 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  38.52 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.78 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  37.5 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  37.9 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  37.62 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  37.11 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  35.59 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  34.02 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  34.19 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  36.89 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  36.73 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  35.4 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  40.86 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.4 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  33.03 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  37.63 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  41.35 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  32.11 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  40.86 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  33.03 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  34.31 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  33.04 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  34.75 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  33.93 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  32.65 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.68 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  35.09 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  26.89 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.97 
 
 
605 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  32.2 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  31.67 
 
 
185 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  36.36 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  34.34 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  28.1 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  30.84 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  32.23 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  30.1 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  34.69 
 
 
688 aa  61.2  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  38.78 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>