177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2228 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2228  signal-transduction protein  100 
 
 
258 aa  517  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2669  putative transcriptional regulator, XRE family  59.54 
 
 
258 aa  315  5e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  57.65 
 
 
260 aa  311  9e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2904  signal-transduction protein  53.28 
 
 
259 aa  286  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  51.55 
 
 
257 aa  258  8e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  33.99 
 
 
258 aa  155  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  34 
 
 
262 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  31.89 
 
 
258 aa  149  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  23.86 
 
 
380 aa  63.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
279 aa  63.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  28.83 
 
 
411 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  25.37 
 
 
313 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  24.03 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  38.71 
 
 
202 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  34.95 
 
 
885 aa  55.8  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  31.29 
 
 
413 aa  55.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  26.13 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  31.03 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  25.95 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1271  signal transduction protein  24.19 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.906703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 
279 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  32.69 
 
 
148 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  29.41 
 
 
348 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  25.77 
 
 
291 aa  52.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  31.71 
 
 
412 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  19.43 
 
 
281 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0164  signal transduction protein  23.13 
 
 
274 aa  52.4  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000193736 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  27.95 
 
 
399 aa  52.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  23.4 
 
 
315 aa  52.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  30.67 
 
 
413 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.21 
 
 
845 aa  52.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  25.94 
 
 
279 aa  52  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  29.63 
 
 
147 aa  52  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  29.22 
 
 
154 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  26.45 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  25.4 
 
 
140 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  29.55 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  25.9 
 
 
161 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  29.91 
 
 
185 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  29.6 
 
 
140 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  23.87 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  25.67 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  33.96 
 
 
863 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  25 
 
 
134 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  25.58 
 
 
865 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
863 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  27.59 
 
 
187 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  28.81 
 
 
144 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  28.81 
 
 
144 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  22.56 
 
 
261 aa  48.9  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.43 
 
 
873 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  27.91 
 
 
867 aa  49.3  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  27.54 
 
 
408 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  27.54 
 
 
408 aa  48.9  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  28.14 
 
 
418 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  36.54 
 
 
211 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  25.21 
 
 
214 aa  48.9  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  25 
 
 
149 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  27.12 
 
 
145 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 
145 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  29.51 
 
 
128 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25.55 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  25.71 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  23.97 
 
 
134 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  27.03 
 
 
331 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  37.88 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  26.67 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  26.8 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  22.91 
 
 
426 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  30.83 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  23.67 
 
 
375 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  30.95 
 
 
613 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  25.18 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  27.49 
 
 
386 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  32.43 
 
 
230 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 
143 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  29.06 
 
 
145 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.65 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  28.33 
 
 
120 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  30.93 
 
 
145 aa  46.6  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  25 
 
 
320 aa  46.6  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  28.33 
 
 
230 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  30.63 
 
 
379 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  27.78 
 
 
133 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  30.11 
 
 
141 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  27.05 
 
 
132 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  30 
 
 
143 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  29.31 
 
 
139 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  31.91 
 
 
883 aa  46.2  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  29.09 
 
 
282 aa  46.2  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  27.01 
 
 
153 aa  45.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 
158 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  28.99 
 
 
513 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  24.59 
 
 
142 aa  45.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  23.74 
 
 
380 aa  45.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>