145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4373 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4373  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  320  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  63.11 
 
 		 168 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  63.93 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  64.75 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  64.75 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  60.66 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  61.82 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  57.94 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  48.78 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2074  signal transduction protein  45.22 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  28.57 
 
 		 249 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  28.21 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  29.47 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.55 
 
 		 488 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.64 
 
 		 488 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  31.97 
 
 		 436 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  25.42 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  30.48 
 
 		 863 aa  52.4  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  28.04 
 
 		 863 aa  51.2  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  31.4 
 
 		 201 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  32.76 
 
 		 269 aa  50.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  31.4 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  23.48 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.64 
 
 		 490 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 		 488 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.27 
 
 		 487 aa  49.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 		 488 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  24.35 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 427 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 		 488 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 		 488 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 		 488 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1269  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.73 
 
 		 488 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000336634  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  24.82 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 		 490 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  26.32 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 		 338 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  28.23 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  28.18 
 
 		 191 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  25.2 
 
 		 230 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  27.43 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  27.43 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  27.43 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  27.97 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  27.03 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  28.69 
 
 		 490 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.91 
 
 		 488 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.91 
 
 		 488 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.91 
 
 		 488 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  28.45 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  29.77 
 
 		 427 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  29.51 
 
 		 433 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  24.24 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.43 
 
 		 486 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  25.41 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  28.69 
 
 		 490 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2729  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.56 
 
 		 487 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0179443  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  25.42 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  27.19 
 
 		 366 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  26.96 
 
 		 486 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  28.07 
 
 		 366 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  28.45 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  29.31 
 
 		 227 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.91 
 
 		 488 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1209  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.91 
 
 		 499 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000206103  hitchhiker  0.00000852941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  27.13 
 
 		 229 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  28.07 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  29.41 
 
 		 382 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 488 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 		 246 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  23.02 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  27.83 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  27.46 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.62 
 
 		 282 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1127  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.56 
 
 		 487 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00407073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.3 
 
 		 494 aa  44.3  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  24.35 
 
 		 292 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  26.96 
 
 		 486 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  25.58 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  26.23 
 
 		 333 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  39.06 
 
 		 307 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  24.22 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  30.21 
 
 		 291 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.47 
 
 		 486 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  26.87 
 
 		 332 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  25.22 
 
 		 769 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  25.76 
 
 		 228 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.68 
 
 		 888 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  27.83 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  40.43 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  25.66 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.18 
 
 		 489 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 		 428 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  25.62 
 
 		 423 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  44.19 
 
 		 399 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  25.23 
 
 		 482 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  27.05 
 
 		 897 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>