More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2079 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2079  signal-transduction protein  100 
 
 
137 aa  261  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266751  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2096  signal-transduction protein  100 
 
 
137 aa  261  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2142  signal-transduction protein  100 
 
 
137 aa  261  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0386104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2330  signal-transduction protein  73.13 
 
 
162 aa  168  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  33.06 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  35.65 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  37.14 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  33.87 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  35.48 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  38 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  34.55 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  25 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  37.5 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  32.06 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  36.19 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  37.17 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  33.06 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  35.14 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  32 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  37.38 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.92 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.48 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  36.36 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  30.77 
 
 
188 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  33.33 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  30.84 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  37.14 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  32.73 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  32.46 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  36.13 
 
 
138 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  28.18 
 
 
147 aa  58.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  37.25 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
143 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  29.17 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  37.17 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  35.96 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0362  signal-transduction protein  33.61 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  28.46 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  34.82 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0201  signal-transduction protein  39.85 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  33.91 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  32.23 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  35.29 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  35.09 
 
 
688 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  37 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  32.41 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2292  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  hitchhiker  0.00000858428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  32.73 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  39.42 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  33.03 
 
 
187 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  37.74 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  31.19 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  27.19 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  28.57 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  36.28 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
688 aa  55.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.93 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  38.39 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  34.55 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2105  signal-transduction protein  36.59 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.141062  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  35.09 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  34.82 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  29.31 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  33.94 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  34.51 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  34.45 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  32.14 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 
143 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  35.92 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 
143 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  31.25 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  29.03 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  34.86 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  29.91 
 
 
146 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  31.67 
 
 
131 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  26.32 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  34.23 
 
 
177 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  29.7 
 
 
145 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  29.03 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  30.28 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  33.06 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  34.51 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  34.23 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.83 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  34.23 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  32 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  31.82 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  33.65 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>