More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6392 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6392  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
133 aa  260  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  64.46 
 
 
130 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  63.64 
 
 
129 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1905  putative signal transduction protein with CBS domains  63.41 
 
 
139 aa  164  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3630  signal-transduction protein  68.38 
 
 
122 aa  163  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  63.64 
 
 
138 aa  158  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1100  signal-transduction protein  62.1 
 
 
152 aa  156  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  60.32 
 
 
126 aa  154  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  39.5 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  40 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.48 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  40.19 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.48 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  39.29 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  47.47 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  36.94 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  34.75 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  36.94 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  34.96 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  39.1 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  35.29 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  37.19 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  36.04 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1597  signal-transduction protein  33.62 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  35.09 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.82 
 
 
143 aa  66.6  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  36.13 
 
 
688 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  40.2 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  32.79 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  39.47 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  36.07 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  36.67 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  34.71 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  40.91 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0633  signal-transduction protein  31.58 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96504  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0628  signal-transduction protein  35.04 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  34.43 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  35.29 
 
 
614 aa  62.8  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  36.97 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  35.29 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  31.09 
 
 
212 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  35.96 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  35.65 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  36.67 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  37.1 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  33.01 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  36.61 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  34.26 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.91 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  36.61 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  34.15 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  35.71 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  34.92 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0939  signal-transduction protein  31.01 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.120432  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  33.63 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  36.75 
 
 
688 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1339  signal-transduction protein  37.5 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  36.67 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  35.29 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  31.4 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  33.61 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  32.77 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  32.33 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  33 
 
 
142 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  37.82 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  32.74 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
688 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0979  signal transduction protein  31.71 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000114145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
645 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  33.06 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  33.79 
 
 
153 aa  57  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  30 
 
 
315 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
645 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
279 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  38.89 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1479  signal-transduction protein  33.87 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  29.37 
 
 
238 aa  57  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.82 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  31.82 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  36.45 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  32.2 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  31.5 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  35.83 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  36.44 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  34.59 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 
279 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1825  signal-transduction protein  32.52 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  30.28 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  31.25 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  35.09 
 
 
600 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  35.29 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  33.06 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  33.33 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>