More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4731 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  100 
 
 
145 aa  295  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  44.64 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  45.69 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  44.83 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  44.9 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  41.23 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  40.8 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  40.8 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  43.86 
 
 
143 aa  84.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  43.59 
 
 
146 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  40.95 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  37.61 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  39.29 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  32.26 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  40.18 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  38.93 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  38.46 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  38.21 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  37.61 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  39.32 
 
 
145 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.75 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  40.78 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  39.83 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  42 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  39.45 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  39.8 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  40.78 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  38.38 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  39.8 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  42.27 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  39.81 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  39.81 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  39.81 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  36.36 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  35.09 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  40.18 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  35.78 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  33.85 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  36 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  38.32 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  41.07 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 
154 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  34.33 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  31.4 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  37.72 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.2 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  36.11 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  35 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  31.06 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  32.71 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  36.7 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  35.09 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  32.23 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  33.04 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  32.8 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  34.45 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  31.88 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  39.25 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  35.04 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  32.8 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  35.19 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.16 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  32.82 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  33.6 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  32.35 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  35.09 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  34.26 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  34.29 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0397  putative signal transduction protein with CBS domains  28.81 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  31.48 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0777  hypothetical protein  29.13 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  40.17 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  34.86 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  33.08 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  29.13 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  32.23 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  32.73 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
185 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  33.04 
 
 
704 aa  62  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.63 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  30.83 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  32.41 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  32.23 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3160  CBS domain containing protein  35.4 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.418255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  34.71 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  34.19 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>