More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5124 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 143 aa  279  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  86.01 
 
 		 143 aa  243  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  65.03 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  64.34 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  64.34 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  63.64 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  55.24 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  55.63 
 
 		 177 aa  149  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  53.15 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  52.45 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  52.45 
 
 		 142 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  52.45 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  50.68 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  48.94 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  50.35 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  49.65 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  49.29 
 
 		 144 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  48.57 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  48.23 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  46.81 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  48.25 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  48.25 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  45.45 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  44.44 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  43.97 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  45.77 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  46.85 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  48.59 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  46.1 
 
 		 144 aa  120  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  47.14 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  48.57 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  45.39 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  45.39 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  43.17 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  46.48 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  42.55 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  45 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  47.14 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  47.14 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  46.85 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  44.37 
 
 		 141 aa  114  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  46.53 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  46.1 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  44.68 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  46.76 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  41.84 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  41.55 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  40.71 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  44.68 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  41.43 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 170 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  42.14 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  42.52 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 		 145 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  39.72 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  38.57 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  38.3 
 
 		 141 aa  95.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  41.43 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  39.29 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  42.25 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.84 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  42.25 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  43.26 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  42.25 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  40.85 
 
 		 153 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  40.14 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  36.17 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  41.13 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  39.72 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  40.85 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  39.01 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  41.84 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  39.16 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  40.14 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  38.03 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2996  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3616  signal-transduction protein  37.06 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  38.3 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.13 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  39.29 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1837  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  36.17 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  35.97 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  37.14 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  42.06 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3779  XRE family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  41.55 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  39.72 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  40.29 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  40.31 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>