More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0523 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0523  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
323 aa  654    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  47.27 
 
 
329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000664449  hitchhiker  0.000000000000829793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  46.2 
 
 
324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  46.65 
 
 
324 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  45.66 
 
 
321 aa  265  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  46.33 
 
 
324 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  44.62 
 
 
333 aa  262  6e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  45.57 
 
 
324 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  46.2 
 
 
344 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  45.57 
 
 
324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  45.25 
 
 
310 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  43.4 
 
 
324 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  45.77 
 
 
324 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  43.08 
 
 
324 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  42.81 
 
 
333 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  46.01 
 
 
324 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  46.08 
 
 
326 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  43.08 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  47.34 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  47.02 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  43.73 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.45 
 
 
328 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.82 
 
 
330 aa  252  7e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  43.44 
 
 
319 aa  251  8.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  44.76 
 
 
326 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.62 
 
 
328 aa  251  9.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  44.69 
 
 
325 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  45.54 
 
 
326 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  46.39 
 
 
315 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  42.44 
 
 
325 aa  250  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  42.27 
 
 
333 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  42.38 
 
 
345 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  42.38 
 
 
345 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.12 
 
 
325 aa  249  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  45.69 
 
 
324 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  42.12 
 
 
325 aa  248  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  45.05 
 
 
324 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  42.12 
 
 
325 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  43.45 
 
 
325 aa  248  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  43.49 
 
 
326 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  42.95 
 
 
326 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  43.93 
 
 
321 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  42.12 
 
 
325 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  43.77 
 
 
323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  42.72 
 
 
339 aa  245  6.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  44.62 
 
 
310 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  43.73 
 
 
326 aa  245  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  41.88 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  43.67 
 
 
333 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  42.11 
 
 
323 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  43.49 
 
 
323 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.3 
 
 
363 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  45.05 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  42.17 
 
 
325 aa  242  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  43.22 
 
 
330 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  40.84 
 
 
325 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  40.84 
 
 
325 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  40.84 
 
 
325 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  40.84 
 
 
325 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  40.13 
 
 
320 aa  241  9e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  40.13 
 
 
320 aa  241  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.35 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  42.44 
 
 
357 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  42.36 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.35 
 
 
328 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.35 
 
 
328 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  43.35 
 
 
328 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.35 
 
 
328 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.35 
 
 
328 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  43.89 
 
 
326 aa  239  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.35 
 
 
328 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  41.8 
 
 
325 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.35 
 
 
328 aa  239  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  43.35 
 
 
328 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  41.25 
 
 
333 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  42.99 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  42.32 
 
 
326 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  41.64 
 
 
333 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  42.72 
 
 
333 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  42.95 
 
 
332 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  43.45 
 
 
318 aa  238  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.35 
 
 
345 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  42.72 
 
 
333 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.09 
 
 
328 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  40.62 
 
 
327 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  42.59 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0629  KpsF/GutQ family protein  43.93 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  39.94 
 
 
320 aa  235  6e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  43.44 
 
 
327 aa  235  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  40.94 
 
 
327 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  43.59 
 
 
324 aa  235  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  42.14 
 
 
322 aa  235  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  41.96 
 
 
339 aa  235  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  42.17 
 
 
323 aa  235  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  46.15 
 
 
326 aa  235  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.81 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.81 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.81 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.81 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  42.19 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>