More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1245 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1245  signal-transduction protein  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3097  hypothetical protein  47.59 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  33.79 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  35 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.25 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  35.62 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  30.83 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  27.66 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  30.5 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  33.1 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  33.79 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  32.17 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  35.88 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  34.15 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  28.38 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  30.88 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3616  signal-transduction protein  31.43 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  30.07 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  30.37 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  32.59 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  28.57 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  29.63 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  29.79 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  30.14 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  33.86 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  29.63 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  30.15 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  26.76 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  27.66 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  30.41 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  27.46 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  33.91 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  30.34 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  26.76 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  27.27 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  26.76 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.76 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  27.41 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  31.13 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  29.66 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  26.95 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  29.63 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.4 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  28.93 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  28.37 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  31.78 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  29.75 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  27.66 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  27.66 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  27.66 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  27.66 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  28.95 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2996  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  27.66 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  33.59 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  26.24 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1523  signal-transduction protein  28.89 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  31.85 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  30.58 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  29.1 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  28.45 
 
 		 627 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  25.56 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  29.1 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  29.1 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  29.41 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  27.42 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  26.87 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  25.93 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  26.28 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.74 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0978  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  28.91 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  30.66 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  26.24 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  24.82 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  28.1 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0870  CBS domain containing protein  29.69 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.258061  normal  0.509671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4959  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  29.63 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  27.74 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1679  CBS domain containing protein  28.12 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  29.86 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  29.05 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3779  XRE family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  31.11 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.68 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>