49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1731 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1731  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
240 aa  474  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2021  signal-transduction protein  40.85 
 
 
236 aa  169  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.297993  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  25.81 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  33.63 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  23.35 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  30.46 
 
 
291 aa  55.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  27.38 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  27.97 
 
 
141 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  29.71 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  31.93 
 
 
303 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  30.25 
 
 
303 aa  48.9  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  32.99 
 
 
144 aa  49.3  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  31.09 
 
 
303 aa  48.9  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.81 
 
 
313 aa  48.9  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 
315 aa  48.5  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  29.01 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  26.62 
 
 
320 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  31.03 
 
 
166 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  34.41 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  25.86 
 
 
262 aa  45.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  24.63 
 
 
331 aa  45.4  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  28.69 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  26.14 
 
 
688 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0468  signal-transduction protein  26.8 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.125396  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  30.25 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  34.62 
 
 
132 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 
137 aa  43.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  20.83 
 
 
143 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  38.37 
 
 
148 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1191  DRTGG domain-containing protein  35.29 
 
 
435 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  31.06 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.83 
 
 
489 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.25 
 
 
145 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  23.18 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  33.68 
 
 
877 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  28.45 
 
 
688 aa  43.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  40.35 
 
 
637 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  35.9 
 
 
164 aa  42.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  42.25 
 
 
130 aa  42.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.88 
 
 
494 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  33.33 
 
 
142 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  25.38 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  32.18 
 
 
145 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.83 
 
 
488 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  28.81 
 
 
688 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.14 
 
 
152 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.51 
 
 
485 aa  42  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  30.58 
 
 
137 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>