257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0468 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0468  signal-transduction protein  100 
 
 		 326 aa  657    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.125396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1479  signal-transduction protein  26.75 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.543565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1395  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 138 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  32.2 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 606 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  31.06 
 
 		 606 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.08 
 
 		 688 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  31.06 
 
 		 606 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  26.88 
 
 		 626 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  32.28 
 
 		 628 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  30.89 
 
 		 132 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  31.78 
 
 		 214 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 130 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 624 aa  53.1  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 		 131 aa  52.8  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3425  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.09 
 
 		 82 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121057  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2021  signal-transduction protein  45.71 
 
 		 236 aa  52.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.297993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  29 
 
 		 128 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  36.47 
 
 		 622 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  34.29 
 
 		 143 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  34.4 
 
 		 141 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  26.99 
 
 		 615 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 		 688 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1394  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 135 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.136388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  30.5 
 
 		 220 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  34.04 
 
 		 124 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  36.63 
 
 		 165 aa  50.4  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  47.06 
 
 		 134 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  48.08 
 
 		 148 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  33.1 
 
 		 153 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  33.1 
 
 		 153 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 623 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4720  thioesterase family protein  32.34 
 
 		 437 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 615 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0517  thioesterase family protein  32.34 
 
 		 437 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.77 
 
 		 837 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  24.32 
 
 		 147 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1450  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.31 
 
 		 762 aa  50.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 		 129 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  30.5 
 
 		 615 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  31.2 
 
 		 230 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0416  signal-transduction protein  34.71 
 
 		 130 aa  49.7  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498724  normal  0.0778746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  43.33 
 
 		 629 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  33.98 
 
 		 645 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  26.29 
 
 		 250 aa  49.3  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  32.31 
 
 		 146 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  30.34 
 
 		 154 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  29.29 
 
 		 242 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4744  thioesterase family protein  31.74 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  28.23 
 
 		 216 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4739  thioesterase family protein  31.74 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  31.91 
 
 		 131 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  28.79 
 
 		 625 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0115  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 393 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  28.45 
 
 		 141 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.99 
 
 		 153 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  30.71 
 
 		 185 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4440  signal-transduction protein  35.9 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  27.63 
 
 		 614 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  44 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  27.56 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4505  thioesterase family protein  31.14 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  31.14 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  31.14 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.21 
 
 		 873 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  32.2 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.35 
 
 		 98 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  31.14 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  29.59 
 
 		 145 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.75 
 
 		 547 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4727  thioesterase family protein  31.14 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  28.24 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 		 615 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  27.05 
 
 		 146 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  32.63 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  31.03 
 
 		 141 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  30 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  29.79 
 
 		 615 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.29 
 
 		 615 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  32.11 
 
 		 140 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  32.79 
 
 		 87 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  32.35 
 
 		 629 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  25.17 
 
 		 269 aa  47  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  35.62 
 
 		 648 aa  46.6  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.35 
 
 		 141 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  29.46 
 
 		 138 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  29 
 
 		 624 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0171  photosystem I subunit VII  39.39 
 
 		 99 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  34.65 
 
 		 216 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  27.34 
 
 		 208 aa  46.6  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  43.14 
 
 		 134 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0506  putative signal transduction protein with CBS domains  33.65 
 
 		 133 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>