18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0252 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0252  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  159  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  45.21 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4510  hypothetical protein  44.59 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4077  protein of unknown function CP12  40.85 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4045  protein of unknown function CP12  45.07 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.661727  normal  0.0123729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3710  hypothetical protein  43.06 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0361  hypothetical protein  45.07 
 
 
75 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.803964  normal  0.324948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1050  hypothetical protein  41.43 
 
 
78 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0914  protein of unknown function CP12  38.03 
 
 
74 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0941  protein of unknown function CP12  38.03 
 
 
74 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1895  protein of unknown function CP12  44.44 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.561735  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  40.91 
 
 
199 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3389  protein of unknown function CP12  38.57 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.324137 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1560  hypothetical protein  42.37 
 
 
80 aa  53.9  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  42.25 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  39.39 
 
 
208 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  46.81 
 
 
208 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  46.81 
 
 
208 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>