19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3389 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3389  protein of unknown function CP12  100 
 
 
75 aa  150  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.324137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1050  hypothetical protein  65.71 
 
 
78 aa  96.7  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0914  protein of unknown function CP12  61.43 
 
 
74 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1560  hypothetical protein  71.43 
 
 
80 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0941  protein of unknown function CP12  61.43 
 
 
74 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4077  protein of unknown function CP12  57.89 
 
 
74 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1895  protein of unknown function CP12  59.46 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.561735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  56.52 
 
 
203 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0361  hypothetical protein  56.76 
 
 
75 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.803964  normal  0.324948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4045  protein of unknown function CP12  51.35 
 
 
77 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.661727  normal  0.0123729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  53.62 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  47.69 
 
 
199 aa  63.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4510  hypothetical protein  55.93 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3710  hypothetical protein  47.95 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0252  hypothetical protein  38.57 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
208 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  38.78 
 
 
208 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  43.75 
 
 
208 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  43.75 
 
 
208 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>