20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4077 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4077  protein of unknown function CP12  100 
 
 
74 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0914  protein of unknown function CP12  75.68 
 
 
74 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0941  protein of unknown function CP12  75.68 
 
 
74 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  60 
 
 
203 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1560  hypothetical protein  60.49 
 
 
80 aa  92.8  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1050  hypothetical protein  62.5 
 
 
78 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3389  protein of unknown function CP12  57.89 
 
 
75 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.324137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1895  protein of unknown function CP12  61.33 
 
 
75 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.561735  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0361  hypothetical protein  56 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.803964  normal  0.324948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4045  protein of unknown function CP12  52.05 
 
 
77 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.661727  normal  0.0123729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3710  hypothetical protein  49.3 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  47.69 
 
 
199 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4510  hypothetical protein  44.44 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  48.61 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0252  hypothetical protein  40.85 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  31.34 
 
 
208 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  32.35 
 
 
208 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1823  hypothetical protein  41.25 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  40.82 
 
 
208 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  40.82 
 
 
208 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>