More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1922 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0468  CBS domain containing membrane protein  29.83 
 
 
195 aa  94.4  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  35.17 
 
 
230 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  29.35 
 
 
449 aa  85.9  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  38.46 
 
 
246 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  34.75 
 
 
132 aa  77  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  33.33 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.93 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  40.56 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  35.62 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.41 
 
 
152 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  27.66 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.78 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  34.25 
 
 
229 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  32.65 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  27.23 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  34.03 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  31.78 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  35.42 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  39.16 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  32.86 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  29.56 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  27.97 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  31.17 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  32.41 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.51 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  34 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 
863 aa  68.2  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.79 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.7 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  33.78 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.03 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.03 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  30.32 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.61 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  27.4 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  31.21 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.81 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  26.34 
 
 
385 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  25.34 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 
863 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  28.57 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  27.33 
 
 
877 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 
390 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  26.85 
 
 
154 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  25.81 
 
 
385 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  33.55 
 
 
158 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
427 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.76 
 
 
769 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  27.59 
 
 
227 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  29.58 
 
 
880 aa  62.8  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  29.61 
 
 
154 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  28.77 
 
 
149 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  27.92 
 
 
382 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 
242 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  33.57 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  31.47 
 
 
243 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  33.33 
 
 
333 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  26.88 
 
 
164 aa  61.6  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  31.29 
 
 
243 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 
155 aa  61.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  32.14 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  29.87 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 
150 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  28.29 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  31.16 
 
 
883 aa  60.1  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
428 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  29.05 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  27.97 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.47 
 
 
845 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  29.08 
 
 
867 aa  59.3  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  31.82 
 
 
698 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 
156 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  27.89 
 
 
376 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  26.34 
 
 
261 aa  58.9  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  27.17 
 
 
383 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
374 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  25 
 
 
411 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  24.19 
 
 
379 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  29.93 
 
 
339 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  32.62 
 
 
120 aa  58.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  29.05 
 
 
149 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30 
 
 
873 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  30.61 
 
 
242 aa  58.2  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.71 
 
 
916 aa  57.8  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  26.67 
 
 
227 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
232 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  32.17 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  31.39 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  27.86 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  28.19 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.54 
 
 
313 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  29.73 
 
 
890 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  26.28 
 
 
423 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>