259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0498 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0498  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1696  CBS domain-containing protein  41.55 
 
 		 163 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000358324  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 688 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  30.28 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.06 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  29.22 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  27.74 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  26.06 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  25.49 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  28.86 
 
 		 427 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  28.24 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  25.71 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  25.95 
 
 		 688 aa  54.7  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  29.5 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  32.14 
 
 		 436 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  25.32 
 
 		 688 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  24.82 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.04 
 
 		 903 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  35.14 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  27.42 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  22.08 
 
 		 153 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  22.08 
 
 		 153 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  28.21 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  26.83 
 
 		 375 aa  52.8  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  28.21 
 
 		 431 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0490  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 321 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  23.74 
 
 		 149 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  29.08 
 
 		 249 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.7 
 
 		 153 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  27.69 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  26.24 
 
 		 909 aa  51.6  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  25.37 
 
 		 663 aa  52  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  25.66 
 
 		 155 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  26.71 
 
 		 152 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1418  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 321 aa  51.6  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  25.35 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  23.38 
 
 		 339 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  28.77 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  30.37 
 
 		 769 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.08 
 
 		 903 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  25.55 
 
 		 333 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  24.16 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  32.58 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  26.32 
 
 		 863 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1218  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 321 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.45 
 
 		 907 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  28.24 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  26.85 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  22.86 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  24.34 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  23.81 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  23.78 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  32.41 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  26.87 
 
 		 645 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  24.65 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  27.27 
 
 		 427 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  24.82 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  27.07 
 
 		 859 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  27.97 
 
 		 907 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  27.1 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  29.32 
 
 		 322 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.83 
 
 		 484 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  30.6 
 
 		 141 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.69 
 
 		 504 aa  48.5  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1710  magnesium transporter  40.35 
 
 		 459 aa  48.9  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  22.7 
 
 		 859 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  28.79 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  23.68 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36397  predicted protein  24.1 
 
 		 759 aa  48.5  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  24.83 
 
 		 142 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  34.92 
 
 		 282 aa  48.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  25.87 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  30.36 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  23.13 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  39.66 
 
 		 875 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0636  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.06 
 
 		 537 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  24.18 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  24.65 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 272 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  26.52 
 
 		 132 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  27.74 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  28.15 
 
 		 904 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  26.21 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  29.1 
 
 		 640 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  34.21 
 
 		 865 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.71 
 
 		 903 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  24.53 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  26.21 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  40.35 
 
 		 442 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  26.21 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  30.71 
 
 		 433 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 		 689 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  42.59 
 
 		 597 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  23.53 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>