30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52444 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  30.34 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  28.47 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  27.66 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  28.67 
 
 		 163 aa  62  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  25.69 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  26.43 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  26.62 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  29.25 
 
 		 522 aa  58.9  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  26.06 
 
 		 479 aa  58.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0965  signal transduction protein  38.67 
 
 		 82 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706266  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51591  calcium binding protein  28.68 
 
 		 132 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  23.42 
 
 		 466 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  27.48 
 
 		 282 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  25 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01938  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.71 
 
 		 82 aa  45.1  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00303105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2045  signal transduction protein  34.48 
 
 		 716 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3291  putative signal transduction protein with EFhand domain  25.17 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5532  putative signal transduction protein with EFhand domain  25.95 
 
 		 291 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  0.0443001 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42946  predicted protein  25 
 
 		 457 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  25.58 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43752  predicted protein  31.15 
 
 		 2360 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.316401  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1792  calcium-binding EF-hand  32.84 
 
 		 127 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.654871  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00260  calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase, putative  24.66 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.877349  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.5 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06566  calcineurin subunit B, putative (Eurofung)  26 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376236  normal  0.7072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0797  ferritin-like protein  34.85 
 
 		 155 aa  41.6  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503852  normal  0.0139535 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02930  EF-hand calcium-binding protein, Caltractin-cdc31 subfamily, putative  26.57 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>