55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28876 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  73.83 
 
 		 149 aa  229  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  69.13 
 
 		 149 aa  222  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  68.46 
 
 		 149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  68.46 
 
 		 149 aa  215  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  49.3 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  44.22 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  45.07 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07850  hypothetical protein  40.74 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.878194  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30461  predicted protein  36.69 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.431532 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51591  calcium binding protein  37.12 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0768  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.87 
 
 		 815 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0739  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.87 
 
 		 815 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50963  predicted protein  37.41 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.343056  normal  0.0795149 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02930  EF-hand calcium-binding protein, Caltractin-cdc31 subfamily, putative  39.44 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03510  myosin, light chain 2, 20 kDa, putative  27.45 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  30.67 
 
 		 479 aa  80.1  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13400  predicted protein  32.39 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  32.45 
 
 		 522 aa  71.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_1103  predicted protein  32.65 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0462074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2925  putative signal transduction protein with EFhand domain  25.17 
 
 		 802 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35710  predicted protein  46.15 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06732  Myosin light chain, putative (Eurofung)  32.69 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06566  calcineurin subunit B, putative (Eurofung)  34.48 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376236  normal  0.7072 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  28.47 
 
 		 192 aa  63.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00260  calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase, putative  32.21 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.877349  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12820  calcium dependent protein kinase  29.93 
 
 		 402 aa  63.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.757606  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_6974  caltractin  27.15 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.503686  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87042  predicted protein  29.93 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02173  calcium-dependent mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  30.39 
 
 		 580 aa  60.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21744  predicted protein  33.99 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06914  EF-hand superfamily Ca2+-modulated protein (AFU_orthologue; AFUA_5G13630)  32.48 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.839556 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31546  predicted protein  28.26 
 
 		 546 aa  57  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.133549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5784  putative signal transduction protein with EFhand domain  39.06 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42946  predicted protein  26.71 
 
 		 457 aa  55.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176816 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  27.03 
 
 		 466 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10513  predicted protein  29.85 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.435374 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_1864  predicted protein  28.97 
 
 		 405 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.827246  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00267  calmodulin, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02930)  27.69 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474974  normal  0.0189303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0965  signal transduction protein  32 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  29.2 
 
 		 282 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01938  putative signal transduction protein with EFhand domain  38.71 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00303105  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05618  Spindle pole body protein An-Cdc31 (Eurofung)  27.61 
 
 		 252 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000742835  normal  0.0267434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2609  hypothetical protein  26.85 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_9233  predicted protein  28 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0107628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48773  predicted protein  24.65 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.879862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2256  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.69 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000735164  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  28.4 
 
 		 798 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2045  signal transduction protein  30.43 
 
 		 716 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148303 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49634  predicted protein  25.17 
 
 		 621 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  27.54 
 
 		 251 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34045  predicted protein  38.1 
 
 		 505 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60109  Mlc2p  30.21 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.778067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0463  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.33 
 
 		 79 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15102  predicted protein  36.07 
 
 		 2759 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>