33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50963 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_50963  predicted protein  100 
 
 
170 aa  340  7e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.343056  normal  0.0795149 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  52.23 
 
 
163 aa  153  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02930  EF-hand calcium-binding protein, Caltractin-cdc31 subfamily, putative  58.74 
 
 
174 aa  145  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05618  Spindle pole body protein An-Cdc31 (Eurofung)  40.46 
 
 
252 aa  120  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000742835  normal  0.0267434 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  40.97 
 
 
149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  40.14 
 
 
149 aa  107  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  41.38 
 
 
149 aa  105  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  39.57 
 
 
154 aa  105  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  40.28 
 
 
149 aa  100  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  37.41 
 
 
149 aa  93.2  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  32.17 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51591  calcium binding protein  35.94 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13400  predicted protein  33.33 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07850  hypothetical protein  32.39 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.878194  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0768  putative signal transduction protein with EFhand domain  28.28 
 
 
815 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0739  putative signal transduction protein with EFhand domain  28.28 
 
 
815 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03510  myosin, light chain 2, 20 kDa, putative  24.57 
 
 
199 aa  57.4  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30461  predicted protein  23.81 
 
 
143 aa  55.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.431532 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12820  calcium dependent protein kinase  27.94 
 
 
402 aa  55.1  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.757606  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  29.71 
 
 
466 aa  55.1  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42946  predicted protein  26.43 
 
 
457 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.176816 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  25.64 
 
 
479 aa  50.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06914  EF-hand superfamily Ca2+-modulated protein (AFU_orthologue; AFUA_5G13630)  31.3 
 
 
213 aa  49.3  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.839556 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_1103  predicted protein  27.21 
 
 
386 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0462074  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_1864  predicted protein  31.62 
 
 
405 aa  48.5  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.827246  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35710  predicted protein  40.32 
 
 
75 aa  48.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02690  mitochondrial inner membrane protein, putative  26 
 
 
698 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_6974  caltractin  27.7 
 
 
151 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.503686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5784  putative signal transduction protein with EFhand domain  37.29 
 
 
73 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31831  centrin-like protein  41.94 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00267  calmodulin, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02930)  23.72 
 
 
243 aa  42  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474974  normal  0.0189303 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21744  predicted protein  37.18 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00260  calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase, putative  32.41 
 
 
175 aa  40.8  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.877349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>