23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5784 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5784  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 
73 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35710  predicted protein  46.27 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  40 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  39.06 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  41.54 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  38.46 
 
 
149 aa  52  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  41.54 
 
 
163 aa  50.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  40.32 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  42.86 
 
 
479 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2256  putative signal transduction protein with EFhand domain  39.71 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000735164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1792  calcium-binding EF-hand  46.55 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.654871  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  37.68 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0463  putative signal transduction protein with EFhand domain  38.71 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2712  Calcium-binding EF-hand-containing protein  36.47 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50963  predicted protein  37.29 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.343056  normal  0.0795149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5331  calcium-binding domain-containing protein  35.82 
 
 
256 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0194602  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34045  predicted protein  38.98 
 
 
505 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51591  calcium binding protein  31.94 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  36.92 
 
 
522 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2045  signal transduction protein  33.87 
 
 
716 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148303 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42946  predicted protein  36.51 
 
 
457 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.176816 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17199  2-phosphoglycolate phosphatase  34.33 
 
 
517 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.493472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>