18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_6974 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_6974  caltractin  100 
 
 
151 aa  303  4.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.503686  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  32 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  27.15 
 
 
149 aa  62  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  29.8 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  28.48 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07850  hypothetical protein  29.08 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.878194  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  28.89 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  29.41 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30461  predicted protein  29.86 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.431532 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  24.67 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0768  putative signal transduction protein with EFhand domain  20.13 
 
 
815 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0739  putative signal transduction protein with EFhand domain  20.13 
 
 
815 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  23.33 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50963  predicted protein  27.7 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.343056  normal  0.0795149 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31831  centrin-like protein  30.33 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35710  predicted protein  29.33 
 
 
75 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02930  EF-hand calcium-binding protein, Caltractin-cdc31 subfamily, putative  30.41 
 
 
174 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48773  predicted protein  27.69 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.879862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>