32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0739 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0768  putative signal transduction protein with EFhand domain  99.26 
 
 
815 aa  1687    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0304  cyclic nucleotide-binding protein  53.44 
 
 
954 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0304  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.44 
 
 
954 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0739  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 
815 aa  1699    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2925  putative signal transduction protein with EFhand domain  61.02 
 
 
802 aa  1058    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0131  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  49.76 
 
 
941 aa  643    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.222865  normal  0.40749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2045  signal transduction protein  51.22 
 
 
716 aa  724    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.148303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4914  cyclic nucleotide-binding protein  50.37 
 
 
943 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  35.21 
 
 
149 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  33.8 
 
 
149 aa  101  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  32.88 
 
 
149 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  33.09 
 
 
149 aa  95.5  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  32.87 
 
 
149 aa  94.4  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  29.53 
 
 
154 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  30.94 
 
 
163 aa  82  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2129  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.89 
 
 
996 aa  76.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0052941 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  27.89 
 
 
163 aa  75.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51591  calcium binding protein  30.95 
 
 
132 aa  75.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30461  predicted protein  33.1 
 
 
143 aa  68.6  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.431532 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50963  predicted protein  28.28 
 
 
170 aa  60.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.343056  normal  0.0795149 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  27.7 
 
 
479 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02930  EF-hand calcium-binding protein, Caltractin-cdc31 subfamily, putative  26.97 
 
 
174 aa  54.3  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03510  myosin, light chain 2, 20 kDa, putative  23.03 
 
 
199 aa  53.9  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35710  predicted protein  41.82 
 
 
75 aa  51.2  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2828  putative ferredoxin-type membrane protein  21.08 
 
 
367 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10513  predicted protein  30.53 
 
 
131 aa  48.1  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.435374 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07850  hypothetical protein  25.19 
 
 
151 aa  48.1  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.878194  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  27.74 
 
 
522 aa  47.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_1103  predicted protein  28.97 
 
 
386 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0462074  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00260  calcium-dependent protein serine/threonine phosphatase, putative  27.54 
 
 
175 aa  45.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.877349  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13400  predicted protein  28.91 
 
 
317 aa  45.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_6974  caltractin  20.13 
 
 
151 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.503686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>