22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30461 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_30461  predicted protein  100 
 
 
143 aa  287  3e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.431532 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07850  hypothetical protein  58.82 
 
 
151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.878194  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06732  Myosin light chain, putative (Eurofung)  53.77 
 
 
110 aa  125  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  41.61 
 
 
149 aa  113  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  39.42 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  39.42 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  36.5 
 
 
149 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  36.69 
 
 
149 aa  101  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  34.06 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  32.58 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0768  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.1 
 
 
815 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0739  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.1 
 
 
815 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  26.62 
 
 
163 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03510  myosin, light chain 2, 20 kDa, putative  27.52 
 
 
199 aa  60.5  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51591  calcium binding protein  24.43 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50963  predicted protein  23.81 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.343056  normal  0.0795149 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35710  predicted protein  36.92 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_6974  caltractin  29.86 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.503686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2925  putative signal transduction protein with EFhand domain  24.09 
 
 
802 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02930  EF-hand calcium-binding protein, Caltractin-cdc31 subfamily, putative  28.99 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08785  mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  28.79 
 
 
707 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.554157 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12820  calcium dependent protein kinase  39.29 
 
 
402 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.757606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>