28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2609 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2609  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3291  putative signal transduction protein with EFhand domain  41.48 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0052  putative signal transduction protein with EFhand domain  35 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3963  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.37 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.738661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3842  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.34 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00258503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2893  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.42 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1449  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.08 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.181348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5447  putative signal transduction protein with EFhand domain  28.18 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1450  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.65 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.755568  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4760  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.66 
 
 		 175 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3475  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.87 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.072615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2712  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.22 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3812  putative signal transduction protein with EFhand domain  26.7 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.435134  decreased coverage  0.00141788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3778  hypothetical protein  29.56 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.916575  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  28.1 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5331  calcium-binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 256 aa  48.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0194602  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  29.33 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  31.72 
 
 		 242 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  26.32 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3688  signal transduction protein  43.4 
 
 		 252 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  28.19 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  28.67 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  26.85 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1615  calcium-binding EF-hand  41.51 
 
 		 262 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  24.54 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06566  calcineurin subunit B, putative (Eurofung)  25.62 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.376236  normal  0.7072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1772  calcium-binding EF-hand  41.51 
 
 		 254 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389103  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87042  predicted protein  34.38 
 
 		 174 aa  41.2  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>