18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3291 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3291  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2609  hypothetical protein  41.48 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0052  putative signal transduction protein with EFhand domain  34.81 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3842  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.53 
 
 		 178 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00258503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3812  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.92 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.435134  decreased coverage  0.00141788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2893  Calcium-binding EF-hand-containing protein  30.11 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5447  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.64 
 
 		 173 aa  84.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3963  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.33 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.738661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1450  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.91 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.755568  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1449  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.63 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.181348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2712  Calcium-binding EF-hand-containing protein  30.41 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3475  Calcium-binding EF-hand-containing protein  25.82 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.072615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3778  hypothetical protein  24.27 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.916575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4760  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.11 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  25.75 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  25.15 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  25.17 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  27.07 
 
 		 282 aa  42  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>