20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1450 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1450  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 174 aa  339  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.755568  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1449  putative signal transduction protein with EFhand domain  65.52 
 
 		 175 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.181348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3842  putative signal transduction protein with EFhand domain  44.97 
 
 		 178 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00258503  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3291  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.91 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0052  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.37 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2609  hypothetical protein  31.65 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5331  calcium-binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0194602  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3812  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.24 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.435134  decreased coverage  0.00141788 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  25.32 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2893  Calcium-binding EF-hand-containing protein  26.16 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815095 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32593  predicted protein  31.52 
 
 		 350 aa  47.8  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0289606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2712  Calcium-binding EF-hand-containing protein  23.49 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3688  signal transduction protein  45.28 
 
 		 252 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  27.33 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  53.06 
 
 		 251 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1772  calcium-binding EF-hand  41.51 
 
 		 254 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389103  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3963  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.16 
 
 		 186 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.738661 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  27.63 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4760  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.21 
 
 		 175 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 		 149 aa  42  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>