57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0950 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  100 
 
 		 242 aa  470  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  35.86 
 
 		 164 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.61 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  39.13 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  38.41 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  32.35 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1772  calcium-binding EF-hand  36.36 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.389103  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  28.64 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  34.04 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  36.84 
 
 		 139 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  33.58 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  34.29 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  33.59 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3230  signal transduction protein  44.71 
 
 		 99 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.263542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  31.72 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  33.33 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  34.84 
 
 		 139 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.74 
 
 		 167 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  27.95 
 
 		 143 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  35.46 
 
 		 124 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.38 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.38 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5447  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.2 
 
 		 173 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2893  Calcium-binding EF-hand-containing protein  25.95 
 
 		 189 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.815095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  30.51 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  32.98 
 
 		 479 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4339  putative signal transduction protein with EFhand domain  42.62 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.1378  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  30.49 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.17 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0271  Calcium-binding EF-hand-containing protein  31.33 
 
 		 130 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0508826 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.32 
 
 		 292 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2609  hypothetical protein  31.72 
 
 		 181 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339179  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3121  EF hand domain-containing protein  40 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  36.9 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  37.25 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  30.53 
 
 		 522 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  27.88 
 
 		 162 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0823  hypothetical protein  36.08 
 
 		 138 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112496 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0795  Calcium-binding EF-hand-containing protein  40.98 
 
 		 396 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  24.11 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  34.52 
 
 		 177 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  28.15 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  26.58 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2224  signal transduction protein  22.16 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2375  calcium-binding EF-hand protein  33.72 
 
 		 169 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  40.54 
 
 		 387 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  40.54 
 
 		 387 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  30.88 
 
 		 188 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1615  calcium-binding EF-hand  40.3 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  28.33 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  35.11 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 118 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  30.88 
 
 		 148 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0305  hypothetical protein  30.51 
 
 		 102 aa  42  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.178613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  28.48 
 
 		 251 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3688  signal transduction protein  38.46 
 
 		 252 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3839  hypothetical protein  36.25 
 
 		 131 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315834  normal  0.233166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>