16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01938 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01938  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 82 aa  166  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00303105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0965  signal transduction protein  68.29 
 
 		 82 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706266  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2369  signal transduction protein  35.71 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  31.51 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  38.71 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  34.62 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  38.67 
 
 		 522 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  33.33 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  31.51 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  31.71 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  27.4 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  36.51 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0768  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.67 
 
 		 815 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0739  putative signal transduction protein with EFhand domain  32.39 
 
 		 815 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02120  calcium ion binding protein, putative  40 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>