16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0965 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0965  signal transduction protein  100 
 
 		 82 aa  167  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01938  putative signal transduction protein with EFhand domain  68.29 
 
 		 82 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00303105  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  38.67 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  46.15 
 
 		 522 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2369  signal transduction protein  35.82 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28876  calmodulin  32 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.603426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  34.21 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  36.36 
 
 		 479 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  37.5 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33596  predicted protein  35.71 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.217543  normal  0.231594 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_25275  predicted protein  32.53 
 
 		 476 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35710  predicted protein  36.21 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  31.43 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  36.76 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2045  signal transduction protein  33.33 
 
 		 716 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0768  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.33 
 
 		 815 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>