36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49634 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_49634  predicted protein  100 
 
 		 621 aa  1275    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387641  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21744  predicted protein  47.02 
 
 		 149 aa  143  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.653699  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  26.38 
 
 		 528 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  34.51 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  31.87 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.15 
 
 		 637 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  28.5 
 
 		 388 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  30.09 
 
 		 357 aa  54.7  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44374  predicted protein  26.72 
 
 		 230 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45252  predicted protein  30.77 
 
 		 277 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  35.85 
 
 		 241 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 		 512 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56522  predicted protein  27.42 
 
 		 230 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  28.57 
 
 		 149 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  24.78 
 
 		 948 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  29.52 
 
 		 441 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 		 227 aa  48.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  25.9 
 
 		 482 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 146 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 141 aa  47.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  38.75 
 
 		 308 aa  47.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 408 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  24.82 
 
 		 482 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  27.04 
 
 		 149 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  24.18 
 
 		 149 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.52 
 
 		 226 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  28.46 
 
 		 263 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  28.23 
 
 		 772 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07850  hypothetical protein  24.36 
 
 		 151 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.878194  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46359  predicted protein  25.19 
 
 		 357 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7608  predicted protein  32.32 
 
 		 137 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 		 157 aa  44.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 		 454 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4499  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 155 aa  43.9  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  38.27 
 
 		 154 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  33.75 
 
 		 412 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>