26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5252 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  100 
 
 		 292 aa  557  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5532  putative signal transduction protein with EFhand domain  81.85 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  0.0443001 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  30.92 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31762  predicted protein  28.66 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248708  normal  0.0201833 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  25.93 
 
 		 522 aa  52.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_52444  caltractin  26.32 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203781  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  32.84 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1459  hypothetical protein  32.28 
 
 		 206 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42106  predicted protein  28.67 
 
 		 163 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.87419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  32.09 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.82 
 
 		 167 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  30.51 
 
 		 282 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.05 
 
 		 194 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  28.3 
 
 		 190 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06280  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  30.93 
 
 		 209 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  29.32 
 
 		 242 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  29.1 
 
 		 139 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39965  predicted protein  27.21 
 
 		 149 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000214549  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  21.77 
 
 		 466 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  30.41 
 
 		 148 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  29.82 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23794  calmoduline  30.77 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02047  Calmodulin (CaM) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P60204]  26.53 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00198053  normal  0.3145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  27.59 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36397  predicted protein  30.85 
 
 		 759 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>