81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3217 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  66.48 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  47.24 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  52.7 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  43.54 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  35.04 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  50.85 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  37.23 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  33.33 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  42.65 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  46.27 
 
 		 109 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  40.62 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  41.27 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  33.91 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  30.82 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  47.62 
 
 		 97 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  33.64 
 
 		 167 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  31.72 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  37.5 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14031  hypothetical protein  31.43 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  36.94 
 
 		 118 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5252  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.01 
 
 		 292 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.849425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  29.8 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  30.56 
 
 		 162 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02173  calcium-dependent mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  32.29 
 
 		 580 aa  48.5  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  40.54 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  43.84 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0655  signal transduction protein  35.59 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  36.04 
 
 		 124 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  44.64 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1140  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.92 
 
 		 269 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46530  hypothetical protein  37.04 
 
 		 101 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00204411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  48.08 
 
 		 136 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  29.85 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0984  hypothetical protein  38.6 
 
 		 87 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  42.86 
 
 		 125 aa  45.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  33.04 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  43.1 
 
 		 266 aa  44.7  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  52.17 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  28.12 
 
 		 139 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3230  signal transduction protein  44.29 
 
 		 99 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.263542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  40.74 
 
 		 122 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  34.41 
 
 		 112 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04241  EF hand domain protein  40 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  35.38 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  46 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17199  2-phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 517 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.493472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  29.13 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0267  calcium-binding EF-hand  40.62 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  35.38 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  29.09 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  30.97 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  44.9 
 
 		 132 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2496  hypothetical protein  30.06 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1843  acid-shock protein  28.57 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.147127  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  38.67 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  48.89 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  33.01 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4832  hypothetical protein  34.41 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128133  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5532  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.58 
 
 		 291 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.351777  normal  0.0443001 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1626  Calcium-binding EF-hand-containing protein  36.84 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  46.94 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  29.45 
 
 		 198 aa  42  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4301  calcium-binding EF-hand-containing protein  30.28 
 
 		 151 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.699333  normal  0.0950575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.03 
 
 		 147 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2277  calcium-binding EF-hand  44 
 
 		 155 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677939  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  30 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  43.4 
 
 		 392 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12351  hypothetical protein  41.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.337711  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  43.75 
 
 		 390 aa  41.6  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  44.68 
 
 		 125 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1174  hypothetical protein  35 
 
 		 133 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.17 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  31.67 
 
 		 133 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  37.65 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.24 
 
 		 139 aa  41.2  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  37.65 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>