34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2059a on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  78.1 
 
 		 96 aa  166  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  62 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  58.1 
 
 		 97 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3880  hypothetical protein  78.85 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46530  hypothetical protein  44.12 
 
 		 101 aa  66.6  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00204411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  47.37 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  39.05 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  45.61 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  45 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  43.08 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  43.33 
 
 		 205 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  42.86 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  39.68 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0984  hypothetical protein  41.18 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0374  hypothetical protein  44.78 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0394  hypothetical protein  44.78 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2769  hypothetical protein  36.92 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0517  hypothetical protein  36.51 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  35.94 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  35.94 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0541  hypothetical protein  36.51 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0584  hypothetical protein  36.51 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506035  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3698  hypothetical protein  34.92 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386998  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  37.25 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1626  Calcium-binding EF-hand-containing protein  36.36 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3359  hypothetical protein  26.89 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  30.53 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1174  hypothetical protein  35.94 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0411  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3453  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1271  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3490  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2491  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>