28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3880 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3880  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  216  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  66.06 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  54.29 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  80 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  54.29 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  46.67 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  56.25 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  57.78 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  43.08 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  41.54 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46530  hypothetical protein  37.97 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00204411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  45.76 
 
 		 194 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0374  hypothetical protein  49.21 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0394  hypothetical protein  49.21 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0984  hypothetical protein  42 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.41 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  40.35 
 
 		 209 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  38 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  51.28 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  51.28 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2769  hypothetical protein  39.06 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  42.22 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  34.55 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0517  hypothetical protein  38.33 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2758  hypothetical protein  38.33 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.48 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3359  hypothetical protein  36.67 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5196  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>