28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1363 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  57.47 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  36.28 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  35.54 
 
 		 170 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  42.42 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  47.92 
 
 		 125 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  40.85 
 
 		 126 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  50 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0543  hypothetical protein  30.85 
 
 		 366 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  51.11 
 
 		 132 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  40.3 
 
 		 125 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3772  hypothetical protein  35.42 
 
 		 106 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  40.3 
 
 		 125 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1626  Calcium-binding EF-hand-containing protein  36.89 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  45.45 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  45.45 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  34.02 
 
 		 131 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  39.58 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2166  calcium-binding EF-hand  40.38 
 
 		 72 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0042  calcium-binding EF-hand-containing protein  35.45 
 
 		 126 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.352285  normal  0.420457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  37.25 
 
 		 105 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0062  calcium-binding EF-hand-containing protein  35.45 
 
 		 126 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  29.46 
 
 		 135 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  32.99 
 
 		 586 aa  42  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  40.48 
 
 		 136 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  37.25 
 
 		 187 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  41.2  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  47.73 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>